Народився 23.04.1884 у Києві. Закінчив Київ. університет (1907), де працював до 1912 і в 1921—41, у 1930—41 — директор Інституту зоології АН УРСР; 1936—48 — Інституту еволюційної морфології АН СРСР, з 1948 працював у Зоол. інституті АН СРСР (з 1955 — зав. лабораторії). Академік АН СРСР з 1935. Був нагороджений державними нагородами СРСР. Помер 7.10.1963. Президією НАН України засновано премію імені І.І. Шмальгаузена, його ім’я присвоєно Інституту зоології НАН України.
Наукові праці присвячено порівняльній анатомії і ембріології, еволюційній морфології, походженню наземних хребетних, вивченню процесів росту організмів, феногенетиці, біокібернетиці, загальнобіологічним проблемам. Встановив закон росту тварин